Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjc1P28229 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjc1P28229 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms