Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfraP26618 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfraP26618 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms