Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
U2af2P26369 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
U2af2P26369 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
U2af2P26369 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms