Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itgb7P26011 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb7P26011 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms