Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms