Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PparaP23204 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PparaP23204 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PparaP23204 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PparaP23204 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms