Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tap1P21958 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tap1P21958 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Tap1P21958 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tap1P21958 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tap1P21958 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tap1P21958 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tap1P21958 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tap1P21958 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tap1P21958 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tap1P21958 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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