Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou5f1P20263 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou5f1P20263 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms