Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NefhP19246 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NefhP19246 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NefhP19246 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NefhP19246 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NefhP19246 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NefhP19246 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms