Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RargP18911 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RargP18911 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RargP18911 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms