Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18532 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18532 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18532 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P18532 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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