Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Hoxb1P17919 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Hoxb1P17919 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxb1P17919 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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