Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PcnaP17918 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PcnaP17918 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms