Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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