Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rag1P15919 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rag1P15919 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rag1P15919 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms