Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim30aP15533 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim30aP15533 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms