Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd44P15379 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms