Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnmt1P13864 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms