Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApcsP12246 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApcsP12246 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApcsP12246 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms