Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd4P10628 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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