Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PolP10400 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PolP10400 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PolP10400 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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