Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb4P10284 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms