Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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