Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Becn2P0DM65 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Becn2P0DM65 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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