Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc8P09025 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms