Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxa5P09021 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa5P09021 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms