Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Col4a2P08122 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a2P08122 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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