Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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TtrP07309 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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TtrP07309 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TtrP07309 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TtrP07309 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms