Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa4P06798 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms