Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PdgfrbP05622 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdgfrbP05622 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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