Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tgfb1P04202 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgfb1P04202 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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