Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01878 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01878 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01878 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01878 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01878 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01878 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01878 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01878 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01878 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms