Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01823 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01823 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01823 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms