Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01740 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01740 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01740 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01740 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01740 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms