Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01659 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01659 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01659 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P01659 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms