Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BlmO88700 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BlmO88700 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BlmO88700 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BlmO88700 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms