Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnmt3aO88508 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3aO88508 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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