Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Foxq1O70220 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Foxq1O70220 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Foxq1O70220 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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