Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rpl35aO55142 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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