Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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