Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BckdkO55028 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdkO55028 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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BckdkO55028 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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BckdkO55028 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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BckdkO55028 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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BckdkO55028 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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BckdkO55028 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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