Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cavin1O54724 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cavin1O54724 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms