Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FxnO35943 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FxnO35943 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FxnO35943 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FxnO35943 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FxnO35943 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FxnO35943 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FxnO35943 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FxnO35943 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FxnO35943 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FxnO35943 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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