Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Bnc1O35914 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Bnc1O35914 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bnc1O35914 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bnc1O35914 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Bnc1O35914 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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