Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl25O35903 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl25O35903 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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