Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm2O35900 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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