Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CaluO35887 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CaluO35887 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CaluO35887 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CaluO35887 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms