Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp2O35711 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp2O35711 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms