Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms