Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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